Shopifyの手数料はいくら？決済手数料・取引手数料・プラン料金の違いと費用を抑えるコツ
Shopify（ショッピファイ）でECサイトを始めようとしたとき、最初に気になるのが「手数料はいくらかかるのか」という点ではないでしょうか。Shopifyには月額のプラン料金のほかに、決済ごとに発生するクレジットカード手数料や、外部決済サービスを使った場合の取引手数料など、複数の手数料が存在します。
これらの手数料の仕組みを正しく理解していないと、「思ったより利益が残らない」「プラン選びを間違えてコストが膨らんだ」という事態になりかねません。特に物販ビジネスでは、利益率が商品の仕入れ価格や送料にも影響されるため、プラットフォームの手数料を含めたトータルコストの把握が非常に重要です。
この記事では、Shopifyの手数料体系をプランごとに詳しく解説するとともに、手数料を抑えるための具体的な方法や、Amazon・BASE・STORESとの比較情報もまとめています。Shopifyでの出店を検討している方や、すでに運営していてコスト削減を考えている方は、ぜひ参考にしてください。
| 確認したいポイント | 結論 | 詳細 |
| Shopifyの手数料の種類は？ | 月額料金・決済手数料・取引手数料の3種類 | 月額プラン料金に加え、決済ごとのクレジットカード手数料、外部決済利用時の取引手数料が発生します |
| 決済手数料はいくら？ | 国内カード3.25〜3.55%、プランで変動 | Shopifyペイメント利用時の手数料で、上位プランほど料率が低くなります。AMEX等は別料率です |
| 取引手数料を無料にできる？ | Shopifyペイメント利用で取引手数料0円 | 外部決済サービスを使うと0.6〜2.0%の取引手数料が追加されますが、Shopifyペイメントなら不要です |
| 他社ECと比べて高い？ | 総合的にはAmazonや楽天より低コスト | Amazonの販売手数料8〜15%、楽天の月額＋手数料と比べると、Shopifyは総費用率が低い傾向にあります |
この記事でわかること
- Shopifyで発生する手数料の種類（月額料金・決済手数料・取引手数料）
- プランごとの手数料率の違いと、月商別の最適プランの選び方
- Shopifyペイメントを活用して取引手数料を0円にする方法
- Amazon・楽天・BASE・STORESとの手数料比較
- 手数料を抑えてEC運営の利益を最大化するコツ
＼ EC・物販の悩み、LINEで今すぐ相談できます ／
自社ECの立ち上げや物販ビジネスの始め方など、プロに無料で相談してみませんか？
目次
Shopifyで発生する手数料の種類を整理しよう
Shopifyの手数料は複数の要素から構成されています。まずは、どのような手数料が発生するのかを整理して、全体像を把握しましょう。
月額のプラン料金
Shopifyには複数の料金プランがあり、月額料金はプランによって異なります。2026年時点の主要プランは以下のとおりです。Starterプランは月額5ドル、Basicプランは月額39ドル（年払いで29ドル）、Growプランは月額105ドル（年払いで79ドル）、Advancedプランは月額399ドル（年払いで299ドル）となっています。
本格的なECサイトを構築するにはBasicプラン以上が必要です。Starterプランは既存のSNSやWebサイトにカート機能を追加するためのプランで、独立したECサイトを作るには機能が不十分です。年払いにすると月額が割引されるため、長期的に運営する予定がある場合は年払いを選ぶとお得です。
なお、大規模なEC事業者向けのShopify Plusプランは月額2,300ドル以上と高額ですが、専任チームによるサポートや高度なカスタマイズ機能が利用できます。月商数千万円以上の規模でなければ必要ありませんが、事業が拡大した際の選択肢として知っておくとよいでしょう。すべてのプランで無料体験が用意されているため、実際の管理画面や機能を試してからプランを決めることができます。
クレジットカードの決済手数料
決済手数料は、顧客がクレジットカードで支払うたびに発生する手数料です。Shopifyペイメント（Shopify独自の決済サービス）を利用した場合の国内発行カードの手数料率は、Basicプランで3.55%、Growプランで3.4%、Advancedプランで3.25%です。
海外発行のクレジットカードの場合は、さらに高い手数料率が適用されます。また、AMEXやJCBなどカードブランドによっても料率が異なる場合があります。越境ECで海外のお客様が多い場合は、この点も考慮してプラン選びをしましょう。
なお、Shopifyの決済手数料はプランによる料率差だけでなく、カードブランドごとの違いにも注意が必要です。VISAやMastercardは標準的な料率が適用されますが、AMEXは一般的にやや高めの料率が設定されています。自分のストアでどのカードブランドが多く使われるかを把握し、手数料のインパクトを予測しておきましょう。Shopifyの管理画面では、決済ごとの手数料を確認・エクスポートできるため、定期的にコスト分析を行うことをおすすめします。
参考：Shopify公式「Shopifyペイメントの支払手数料を確認する」
外部決済サービス利用時の取引手数料
Shopifyでは、Shopifyペイメント以外の外部決済サービス（PayPal、Amazon Pay、KOMOJUなど）を利用することもできます。ただし、外部決済サービスを利用した場合は、決済手数料に加えて、Shopifyの取引手数料が別途発生します。
取引手数料の料率はプランによって異なり、Basicプランで2.0%、Growプランで1.0%、Advancedプランで0.6%です。つまり、外部決済を使うと「決済手数料＋取引手数料」の二重コストがかかることになります。
この取引手数料は、Shopifyペイメントを利用すれば0円になります。Shopifyペイメントの導入は手数料削減の最も効果的な方法であり、特別な理由がない限りShopifyペイメントを利用することを強くおすすめします。
▶ 関連記事：【2026年最新】メルカリ手数料の裏ワザ8選｜販売手数料10%を実質的に下げる節約術
＼ EC・物販の悩み、LINEで今すぐ相談できます ／
自社ECの立ち上げや物販ビジネスの始め方など、プロに無料で相談してみませんか？
プランごとの手数料を比較して最適なプランを選ぼう
Shopifyは上位プランほど月額料金が高くなる一方、決済手数料率は低くなるトレードオフの構造になっています。月商規模に応じた最適なプラン選びが、手数料を抑える鍵です。
月商別のプラン選びの目安
プラン選びで最も重要なのは、月額料金の差額と、手数料率の差による節約額を比較することです。月商が小さいうちはBasicプランの月額が安いメリットが大きく、月商が大きくなるほど上位プランの手数料率の低さが効いてきます。
目安として、月商50万円以下であればBasicプランが最もコスト効率が良い傾向にあります。月商50万〜200万円程度であればGrowプラン、月商200万円以上であればAdvancedプランを検討する価値があります。ただし、この目安はあくまで手数料コストだけの比較であり、各プランで使える機能の違いも考慮して判断しましょう。
たとえばGrowプランでは、Basicプランにはないスタッフアカウントの追加や詳細なレポート機能が使えるようになります。Advancedプランでは、カスタムレポートや外部計算配送料の設定など、より高度な機能が利用可能です。月商規模と必要な機能のバランスを考えて、最適なプランを選びましょう。具体的な損益分岐点は、月商×（上位プランの手数料率との差）が月額料金の差額を上回るかどうかで計算できます。
年払いで月額コストを下げる
Shopifyの主要プランでは、年払いを選択することで月額料金が約25%割引されます。たとえばBasicプランは月払いで39ドルですが、年払いにすると月額換算で29ドルになり、年間で120ドル（約18,000円）の節約になります。
Growプランでは年間312ドル（約47,000円）、Advancedプランでは年間1,200ドル（約180,000円）もの差が生まれます。1年以上継続して運営する予定がある場合は、年払いにするだけで大きなコスト削減を実現できます。
ただし、年払いにした場合、途中でプランを変更したくなっても返金されないケースがある点には注意が必要です。まずは月払いで1〜2か月試してから、事業として継続できると判断した時点で年払いに切り替えるのが安全な進め方です。プランのダウングレードは管理画面からいつでも可能ですが、差額の返金条件はShopifyの規定を確認してください。
不要な有料アプリの見直しでコストを削減する
Shopifyの手数料以外に見落としがちなのが、有料アプリの月額費用です。Shopifyは豊富なアプリで機能を拡張できるのが魅力ですが、アプリを追加するごとに月額料金が積み重なります。
使っていないアプリや、無料の代替手段がある有料アプリがないか定期的に見直しましょう。月額10ドルのアプリを3つ使っていれば月30ドル（約4,500円）のコストが発生しており、年間では54,000円にもなります。本当に必要なアプリだけを残すことが、EC運営の利益率改善につながります。
Shopifyの無料テーマには基本的なEC機能が一通り備わっているため、有料テーマを購入しなくても運営は可能です。ブランドの世界観を表現したい場合は、200〜350ドル程度の買い切り型有料テーマの導入も検討する価値があります。有料テーマは月額コストが増える有料アプリとは異なり、一度だけの投資で済むため、長期的に見ればコストパフォーマンスは高いです。
▶ 関連記事：Amazonせどりは儲からない？Amazon物販で稼ぐ方法3選
＼ EC・物販の悩み、LINEで今すぐ相談できます ／
自社ECの立ち上げや物販ビジネスの始め方など、プロに無料で相談してみませんか？
Shopifyペイメントで手数料を最小化する方法
Shopifyの手数料を抑える最大のポイントは、Shopifyペイメントの活用です。ここでは、Shopifyペイメントの仕組みとメリットを詳しく解説します。
Shopifyペイメントとは
Shopifyペイメントは、Shopifyが提供する独自の決済サービスです。導入するとクレジットカード（Visa・Mastercard・AMEX・JCBなど）やApple Pay、Google Payなど、主要な決済方法を一括で利用できるようになります。
最大のメリットは、Shopifyペイメントを利用すると外部決済サービスの取引手数料（0.6〜2.0%）が完全に無料になる点です。初期費用や振込手数料も発生しないため、コスト面で非常に有利です。また、入金サイクルも最短5営業日と短く、資金繰りの面でも安心です。
Shopifyペイメントの導入は管理画面から数クリックで完了し、追加の審査や契約手続きも基本的に不要です。外部の決済代行会社と個別に契約する手間が省けるため、EC立ち上げの初期段階でも迅速に販売を開始できます。特に物販ビジネスでは、販売開始までのスピードが重要です。在庫を抱えている間にもコストが発生するため、決済環境を素早く整えて販売を始められるShopifyペイメントの手軽さは大きなメリットと言えます。
Shopifyペイメントの注意点
Shopifyペイメントを利用する際の注意点として、支払い確定期限が7日間に設定されている点があります。注文から7日以内に支払いを確定する必要があるため、受注生産品や取り寄せ商品など発送までに時間がかかる商品を扱う場合は注意が必要です。
また、Shopifyペイメントはすべての国・地域で利用できるわけではありません。日本では利用可能ですが、特定の業種（アダルト、ギャンブルなど）は利用制限がかかる場合があります。自分のビジネスがShopifyペイメントの利用規約に適合しているか、事前に確認しておきましょう。
Shopifyペイメントが利用できない業種の場合は、外部決済サービスを利用することになります。その場合、取引手数料が追加で発生するため、PayPalやStripeなどの外部決済サービス自体の手数料と合わせて、トータルコストがどの程度になるかを事前にシミュレーションしておくことが重要です。コスト管理を怠ると、売上が伸びても利益が残らないという事態に陥りかねません。
▶ 関連記事：物販ビジネスは儲かる？ビジネスモデルと初心者が稼ぐための7つの秘訣
Shopifyと他社ECプラットフォームの手数料を比較
Shopifyの手数料が高いのか安いのかを判断するために、他の主要ECプラットフォームとの比較を行います。
Amazonとの手数料比較
Amazonの販売手数料はカテゴリーごとに8〜15%と幅があり、さらにFBA（フルフィルメント by Amazon）を利用すると配送代行手数料と在庫保管手数料が追加されます。大口出品プランの月額は4,900円（税抜）です。FBAを利用した場合、販売手数料＋FBA手数料で商品価格の20〜30%がコストとして差し引かれるケースも珍しくありません。
Shopifyの場合、Shopifyペイメントを使えば決済手数料3.25〜3.55%のみで済むため、手数料率だけを見ればAmazonよりも大幅に低コストです。ただし、Amazonには圧倒的な集客力があるため、「集客コストを含めたトータルコスト」で比較することが重要です。自社ECのShopifyは集客を自分で行う必要がある点を考慮しましょう。
理想的なのは、Amazonで売上の基盤を作りながら、並行してShopifyで自社ECサイトを育てていく方法です。Amazonでの販売実績やブランド認知が高まったタイミングで、自社ECに顧客を誘導すれば、手数料の低いShopifyで利益率を高めることができます。多くの成功しているEC事業者は、Amazonとshopifyを併用してリスク分散と利益率の最大化を実現しています。
BASE・STORESとの手数料比較
BASEやSTORESには無料プランがあるため、初期費用ゼロでECサイトを始められるメリットがあります。しかし、無料プランの場合は決済手数料が高めに設定されているのが一般的です。
たとえばBASEのスタンダードプランでは、サービス利用料3%＋決済手数料3.6%＋40円が発生し、実質的な手数料率は6%を超えます。STORESのフリープランも決済手数料が5%です。月商が増えるほどこの差は大きくなるため、月商20万円以上を安定して超える見込みがあるなら、Shopifyのほうがコスト面で有利になるケースが多いです。
Shopifyの強みは、手数料の低さに加えて、カスタマイズ性の高さ、越境EC対応、豊富なアプリエコシステムにあります。事業を拡大していく前提であれば、初期段階からShopifyを選んでおくのが合理的な選択です。
また、Shopifyは世界175か国以上で利用されているグローバルプラットフォームであるため、将来的に越境EC（海外販売）に進出したい場合にもスムーズに対応できます。多言語・多通貨対応が標準で備わっており、海外向けの配送設定や税金設定も管理画面から簡単に行えます。BASEやSTORESは基本的に国内向けのサービスであるため、この点はShopifyの大きなアドバンテージです。
▶ 関連記事：無在庫転売はオワコンなの？無在庫転売がオワコンな理由を解説
＼ EC・物販の悩み、LINEで今すぐ相談できます ／
自社ECの立ち上げや物販ビジネスの始め方など、プロに無料で相談してみませんか？
まとめ：Shopifyの手数料を理解して賢くEC運営を始めよう
Shopifyの手数料は、月額のプラン料金・決済手数料・取引手数料の3つで構成されています。手数料を最小化するためのポイントは、Shopifyペイメントを導入して取引手数料を0円にすること、月商規模に合ったプランを選ぶこと、年払いを活用することの3つです。
Amazon・楽天などのモール型ECと比較すると、Shopifyの手数料率は総合的に低く、自社ブランドのECサイトを運営するプラットフォームとしてはコストパフォーマンスが高いと言えます。ただし、Shopifyは自社ECサイトであるため集客を自分で行う必要がある点は理解しておきましょう。SEO対策やSNSマーケティング、広告運用などの集客施策にもコストと労力がかかるため、手数料だけでなく集客コストも含めた総合的な費用対効果で判断することが大切です。
物販ビジネスでは、プラットフォームの手数料だけでなく、仕入れ原価・送料・梱包資材費・広告費まで含めたトータルコストで利益を管理することが重要です。Shopifyの手数料を正しく理解し、無駄なコストを削減することで、EC運営の利益を最大化していきましょう。
Shopifyは物販ビジネスの拡大フェーズにおいて、自社ブランドの世界観を表現できる自由度の高いプラットフォームです。手数料の安さだけでなく、デザインのカスタマイズ性、越境EC対応、マーケティングツールとの連携のしやすさなど、長期的な事業成長を見据えて選ぶことが成功のポイントです。
ECサイトの立ち上げや物販ビジネスの始め方について相談したい方は、ぜひ物販NAVIの公式LINEからお気軽にお問い合わせください。Shopify以外のプラットフォーム選びのアドバイスも含めて、無料でサポートいたします。Amazon、メルカリ、Shopifyなど複数の販路を組み合わせた物販戦略のご相談も受け付けています。
＼ EC・物販の悩み、LINEで今すぐ相談できます ／
自社ECの立ち上げや物販ビジネスの始め方など、プロに無料で相談してみませんか？
コメント