せどりの確定申告のやり方｜副業でも必要？経費や青色申告の手順をわかりやすく解説

2026年7月27日

「せどりで利益が出たけれど、確定申告は必要なのだろうか」「副業の確定申告ってどうやればいいのかわからない」と不安を感じていませんか。

せどりで一定以上の所得を得た場合、本業・副業にかかわらず確定申告が必要です。確定申告を怠ると、延滞税や無申告加算税などのペナルティが課される可能性があります。逆に、経費や控除を正しく計上すれば、払い過ぎた税金が戻ってくるケースもあります。

この記事では、せどりの確定申告が必要になる条件、青色申告と白色申告の違い、経費として計上できる項目、具体的な申告手順、そして副業バレを防ぐ方法まで、初めて確定申告する方にもわかりやすく解説します。

確認したいポイント	結論	詳細
せどりに確定申告は必要？	副業は所得20万円超、本業は48万円超で必要	売上から経費を引いた所得が基準を超えると確定申告の義務が発生します。不用品の売却は原則として非課税です
青色申告と白色申告の違いは？	青色は節税効果が大きく、白色は手間が少ない	青色申告は最大65万円の特別控除が受けられますが、複式簿記での記帳と事前届出が必要です
せどりで経費にできるものは？	仕入代金・送料・手数料・梱包材などが対象	販売プラットフォームの手数料やリサーチツールの利用料、事業用の通信費なども経費として計上できます
確定申告の具体的な手順は？	帳簿付け→書類作成→申告書提出の3ステップ	1年間の売上と経費を帳簿にまとめ、確定申告書を作成して翌年2月16日〜3月15日に税務署へ提出します
事業所得と雑所得の違いは？	継続的・本格的なせどりは事業所得になり得る	事業所得なら青色申告が可能で損失の繰越もできますが、副業の小規模なせどりは雑所得に分類されます
会計ソフトは必要？	初心者ほどクラウド会計ソフトの活用がおすすめ	freeeや弥生、マネーフォワードなどを使えば自動仕訳や申告書作成が簡単にでき、記帳ミスも減らせます
確定申告しないとどうなる？	延滞税・無申告加算税などのペナルティが発生	悪質な場合は重加算税が課されることもあり、最大で本来の税額の40%が加算される可能性があります
副業せどりが会社にバレない方法は？	住民税の普通徴収を選択すればリスクを軽減	確定申告時に住民税の納付方法を「自分で納付（普通徴収）」に変更することで、会社への通知を防げます

この記事でわかること

せどりで確定申告が必要になる条件（本業・副業別）
青色申告と白色申告の違いと、どちらを選ぶべきかの判断基準
せどりで経費に計上できる項目と、計上時の注意点
確定申告書の作成から提出までの具体的な手順
副業せどりが会社にバレないための住民税対策

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せどりで確定申告が必要になる条件

せどりで利益が出たからといって、必ずしも全員が確定申告をしなければならないわけではありません。確定申告が必要かどうかは、本業か副業か、そして所得の金額によって異なります。

本業でせどりをしている場合

個人事業主としてせどりを本業にしている場合、年間の所得が基礎控除額を超えると確定申告が必要です。2024年分までの基礎控除額は48万円ですが、2025年分は95万円、2026年分は104万円に引き上げられています（国税庁「No.1199 基礎控除」参照）。

ここでいう所得とは、せどりの売上金額から仕入代金や経費を差し引いた金額のことです。たとえば年間の売上が300万円で、仕入れや経費が合計260万円だった場合、所得は40万円となり、2024年分なら基礎控除48万円以下のため確定申告は不要ですが、売上や経費の構成によって結果は変わります。

副業でせどりをしている場合

会社員やパート勤務の方が副業としてせどりを行っている場合、給与所得以外の所得が年間20万円を超えると確定申告が必要になります。本業の給与から天引きされている税金とは別に、副業の所得分に対する所得税を自分で申告・納付する義務があります。

ただし注意すべきは、所得税の確定申告が不要でも住民税の申告は必要だという点です。副業の所得が20万円以下で確定申告が不要な場合でも、1円でも利益が出ていれば住民税の申告が必要になるケースがあります。お住まいの市区町村の窓口に確認しておきましょう。

確定申告が不要なケース

事業目的ではなく、自分や家族が使っていた不用品をフリマアプリなどで売却した場合は、原則として確定申告は不要です。所得税法では「生活用動産」の売却益は非課税と定められています。ただし、1点30万円を超える貴金属や骨董品、美術品などは生活用動産の対象外となるため注意が必要です。

青色申告と白色申告の違い｜せどりにはどちらが有利？

確定申告には青色申告と白色申告の2種類があります。それぞれの特徴を理解し、自分のせどりの規模に合った方法を選びましょう。

青色申告のメリットと条件

青色申告は、最大65万円の青色申告特別控除を受けられるのが最大のメリットです。たとえば所得が100万円の場合、青色申告特別控除を適用すれば課税所得を35万円まで圧縮でき、所得税の負担を大きく軽減できます。

さらに、赤字が出た年の損失を最大3年間繰り越せる「欠損金の繰越控除」や、家族に給与を支払って経費にできる「青色事業専従者給与」など、白色申告にはない節税制度が利用できます。ただし、青色申告を行うには複式簿記での記帳が求められるほか、事前に「所得税の青色申告承認申請書」を税務署に提出しておく必要があります。

なお、青色申告が認められるのは「事業所得」として申告する場合に限られます。副業のせどりが「雑所得」に分類される場合は白色申告しか選択できないため、事業所得として認められる規模かどうかの判断が重要になります。

白色申告の特徴と向いている人

白色申告は、青色申告と比べて記帳や手続きが簡素で手間が少ないのが特徴です。簡易簿記での記帳が認められており、複式簿記の知識がなくても対応できます。

青色申告特別控除や欠損金の繰越控除といった節税メリットはありませんが、せどりを始めたばかりで取引件数が少ない方や、副業で規模が小さい方にはまず白色申告から始め、事業が拡大してきたら青色申告に切り替えるという段階的なアプローチがおすすめです。

事業所得と雑所得の判断基準

せどりの所得を「事業所得」と「雑所得」のどちらで申告するかは、継続性・営利性・社会的地位などから総合的に判断されます。本業として継続的にせどりを行い、相応の収入規模がある場合は事業所得、副業で小遣い稼ぎ程度の収入であれば雑所得に分類されるのが一般的です。

事業所得として認められるには、開業届の提出、専用の銀行口座の開設、継続的な帳簿の記帳など、事業として運営している実態を示すことが重要です。判断に迷う場合は、税務署や税理士に相談することをおすすめします。

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せどりの確定申告で経費にできるもの・できないもの

確定申告において、経費を正しく計上することは節税の基本です。ここでは、せどりで経費として認められる項目と、計上時に注意すべきポイントを解説します。

経費として計上できる主な項目

せどりで経費として認められる代表的な項目は、仕入代金（売上原価）、販売手数料、送料、梱包材費、通信費、交通費、リサーチツール利用料などです。具体的には以下のような支出が経費に該当します。

仕入代金は最も大きな経費であり、商品の購入費用そのものです。Amazonの販売手数料やFBA手数料、メルカリの出品手数料なども経費に含まれます。商品の配送に使った送料や、段ボール・緩衝材などの梱包資材費も経費です。

また、せどりのリサーチに使うKeepaやモノトレーサーの有料プラン、会計ソフトの利用料、事業用に使っているスマートフォンやパソコンの購入費用（減価償却）、インターネット回線料金（事業利用分）、仕入れのための交通費なども計上できます。せどりに関する書籍やセミナーの参加費も研修費として経費になります。

経費にできないもの・注意が必要なもの

せどりと無関係なプライベートの支出は経費にできません。たとえば、事業とは関係のない書籍代や食事代、私的な旅行費用などを経費に含めると、税務調査で否認される可能性があります。

スマートフォンやインターネット回線など、事業とプライベートの両方で使用しているものについては「家事按分」が必要です。事業での利用割合を合理的に算出し、その割合分のみを経費として計上します。たとえばスマートフォンの利用時間のうち事業利用が50%であれば、通信費の50%を経費にできるという考え方です。

経費の証拠となるレシートや領収書、クレジットカード明細書などは必ず保管しておきましょう。青色申告の場合は原則7年間、白色申告の場合は5年間の保存が義務づけられています。

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せどりの確定申告のやり方｜具体的な手順を解説

ここでは、せどりの確定申告を実際に進めるための手順をステップごとに解説します。初めて確定申告する方でもこの流れに沿って進めれば、スムーズに申告を完了できます。

ステップ1：1年間の売上と経費を帳簿にまとめる

確定申告の第一歩は、1月1日から12月31日までの1年間の売上と経費を帳簿にまとめることです。Amazonやメルカリなどの販売プラットフォームの売上明細をダウンロードし、月ごとの売上金額を集計します。

経費についても、仕入代金・手数料・送料・梱包材費・通信費など項目ごとに集計します。クレジットカード明細や銀行の入出金履歴と突き合わせ、漏れがないか確認しましょう。会計ソフトを使えば、銀行口座やクレジットカードと連携して自動で取引データを取り込めるため、記帳の手間を大幅に削減できます。

ステップ2：年末の在庫を棚卸しする

せどりの確定申告では、12月31日時点で売れ残っている在庫の金額を「棚卸資産」として計上する必要があります。仕入れた商品がすべて経費になるわけではなく、年末時点で手元に残っている商品の仕入代金は、その年の経費からは除外されます。

棚卸しでは、在庫の数量と仕入単価を一覧にまとめた「棚卸表」を作成します。在庫金額の計算方法にはいくつかありますが、せどりでは「最終仕入原価法」が一般的です。この方法では、最後に仕入れた時の単価をもとに在庫金額を計算します。

ステップ3：確定申告書と添付書類を作成する

帳簿の集計が終わったら、確定申告書を作成します。事業所得として申告する場合は「確定申告書B」と、青色申告なら「青色申告決算書」、白色申告なら「収支内訳書」を作成します。

国税庁の「確定申告書等作成コーナー」を利用すれば、画面の案内に沿って数値を入力するだけで申告書が完成します。また、freeeや弥生、マネーフォワードなどのクラウド会計ソフトを使えば、日々の記帳データから自動的に申告書類を生成してくれるため、さらに簡単です。

ステップ4：税務署に申告書を提出する

確定申告書の提出期間は、原則として翌年の2月16日から3月15日までです。提出方法は、税務署への持参、郵送、そしてe-Tax（電子申告）の3通りがあります。e-Taxを利用すれば自宅からオンラインで申告が完了するため、税務署に行く手間が省けます。

なお、e-Taxで青色申告を行い、65万円の特別控除を受けるにはマイナンバーカードが必要です。まだ取得していない方は、早めに申請しておきましょう。所得税の納付は現金納付のほか、口座振替やクレジットカード納付、コンビニ納付にも対応しています。

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せどりの確定申告に必要な仕訳の具体例

確定申告のためには日々の取引を正しく仕訳する必要があります。ここでは、せどりでよく発生する取引パターンの仕訳例を紹介します。会計ソフトを使う場合でも基本的な仕訳の考え方を理解しておくと、入力ミスを防げます。

商品を仕入れたときの仕訳

せどりで商品を仕入れた場合、「仕入高」として記帳します。たとえば楽天市場で5,000円の商品をクレジットカードで購入した場合、借方に「仕入高 5,000円」、貸方に「未払金（クレジットカード）5,000円」と記帳します。現金で支払った場合は貸方が「現金 5,000円」になります。

仕入れの際にかかった送料も、商品の取得に直接関係する費用として仕入高に含めるか、「荷造運賃」として別に計上することができます。どちらの方法でも構いませんが、1年間を通じて一貫した処理を行うことが重要です。

商品が売れたときの仕訳

Amazonで商品が売れた場合、売上金額から販売手数料やFBA手数料が差し引かれた金額が入金されます。この場合、売上の全額を「売上高」として計上し、手数料は「支払手数料」として経費に計上するのが正しい処理です。

たとえば10,000円で販売し、Amazonの手数料が1,500円引かれて8,500円が入金された場合、借方に「売掛金 8,500円」と「支払手数料 1,500円」、貸方に「売上高 10,000円」と記帳します。メルカリの場合も同様に、販売手数料（売上の10%）を差し引いた金額が売上金として計上されるため、手数料分は別途経費として記帳しましょう。

ポイントで仕入れた場合の処理

楽天ポイントやPayPayポイントを使って商品を仕入れた場合の処理は、ポイント分も仕入高として計上し、同時に「雑収入」として計上するのが一般的な方法です。たとえば5,000円の商品を2,000ポイント＋現金3,000円で購入した場合、仕入高は5,000円、雑収入（ポイント利用分）が2,000円となります。

ポイントの取り扱いは税務上の判断が分かれることもあるため、大量にポイントを活用している方は税理士に相談しておくと安心です。いずれにしても、ポイントの使用履歴は記録しておくようにしましょう。

せどりの確定申告で注意すべきポイント

確定申告は正しく行わないと、思わぬペナルティを受けたり、副業が会社にバレたりするリスクがあります。ここでは、せどりの確定申告で特に注意すべき3つのポイントを解説します。

確定申告を怠った場合のペナルティ

確定申告の義務があるにもかかわらず申告しなかった場合、無申告加算税や延滞税などのペナルティが課されます。無申告加算税は、納付すべき税額に対して原則15%（50万円を超える部分は20%）が加算されます。

さらに、意図的に申告しなかった場合や虚偽の申告を行った場合には「重加算税」が課され、最大40%の加算となる可能性があります。「少額だからバレないだろう」と安易に考えるのは危険です。Amazonやメルカリなどのプラットフォームの取引データは税務署が把握できる仕組みになっているため、無申告は発覚するリスクが高いことを認識しておきましょう。

副業せどりが会社にバレないための住民税対策

副業としてせどりを行っている会社員が最も気にするのは、「確定申告をすると会社に副業がバレるのではないか」という点でしょう。通常、確定申告で申告した所得に基づいて住民税が計算され、会社の給与から天引きされます。副業分の住民税が上乗せされることで、会社の経理担当者に気づかれる可能性があります。

対策としては、確定申告書の「住民税に関する事項」欄で、副業分の住民税の納付方法を「自分で納付（普通徴収）」に変更する方法があります。これにより、副業分の住民税は自宅に届く納付書で個別に支払うことになり、会社の給与からは天引きされなくなります。ただし、自治体によっては普通徴収への切り替えに対応していない場合もあるため、事前にお住まいの市区町村に確認しておきましょう。

帳簿や領収書の保管義務

確定申告を行った後も、帳簿や関連書類は一定期間保管する義務があります。青色申告の場合、帳簿や決算書類は原則7年間、請求書・領収書などは5年間の保存が必要です。白色申告でも帳簿は5年間の保存義務があります。

保管すべき書類としては、仕入れのレシートや領収書、クレジットカード明細、販売プラットフォームの売上明細、銀行の入出金履歴、棚卸表などが挙げられます。紙の書類はスキャンしてデジタル保存することも認められていますので、場所を取らずに保管したい方は電子保存の活用を検討してみてください。

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せどりの確定申告を楽にするクラウド会計ソフト

せどりの確定申告で最もハードルが高いのは、日々の帳簿付けと申告書類の作成です。クラウド会計ソフトを活用すれば、これらの作業を大幅に効率化できます。

クラウド会計ソフトを使うメリット

クラウド会計ソフトの最大のメリットは、銀行口座やクレジットカードと連携して取引データを自動で取り込み、仕訳を自動化してくれる点です。手入力の手間が大幅に減り、記帳ミスも防止できます。

また、日々の記帳データをもとに確定申告書や青色申告決算書を自動生成する機能があるため、書類作成にかかる時間も短縮できます。e-Taxとの連携に対応しているソフトであれば、申告書の提出まで画面上で完結できます。初心者でも直感的に操作できるインターフェースのソフトが多く、会計の専門知識がなくても安心して使えるのが魅力です。

代表的なクラウド会計ソフト3選

せどりの確定申告でよく使われているクラウド会計ソフトとしては、freee会計、弥生のクラウド確定申告、マネーフォワードクラウド確定申告の3つが代表的です。

freee会計はスマートフォンアプリの操作性が高く、質問に答えるだけで確定申告書が作成できるのが特徴です。弥生は個人事業主向けの「やよいの青色申告オンライン」「やよいの白色申告オンライン」があり、白色申告なら初年度無料で利用できます。マネーフォワードは他のマネーフォワードサービスとの連携が便利で、経費精算や請求書発行も一元管理できます。

いずれのソフトも無料プランやお試し期間が用意されているため、まずは無料で試してみて自分に合ったものを選ぶとよいでしょう。

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確定申告の手間を減らすなら物販ビジネスのステップアップも視野に

せどりの確定申告は、取引件数が増えるほど帳簿付けの手間も膨らみます。仕入れと販売を繰り返すせどりでは、1年間で数百件〜数千件の取引が発生することも珍しくなく、経理作業に追われて本業のリサーチや仕入れに集中できないという悩みを抱える方も少なくありません。

こうした課題を根本的に解決する方法の一つが、OEM（自社ブランド商品）の展開にステップアップすることです。OEMでは取り扱う商品が自社ブランドの少数アイテムに集約されるため、帳簿付けがシンプルになります。さらに、利益率が高く価格競争が発生しにくいため、少ない取引件数でもせどりと同等以上の利益を確保できる可能性があります。

せどりで培った仕入れ力や市場分析力はOEMビジネスにも直結するスキルです。確定申告を通じて自分のビジネスの数字を客観的に把握できるようになったら、次のステップとしてOEM・自社ブランドの構築を検討してみてはいかがでしょうか。

▶ 関連記事：せどりに疲れてしまう理由と対処法

まとめ

せどりの確定申告は、副業の場合は所得20万円超、本業の場合は所得48万円超（2024年分）で義務が発生します。申告の方法には青色申告と白色申告があり、本格的にせどりを行うなら最大65万円の控除が受けられる青色申告が有利です。

経費として計上できるのは、仕入代金・販売手数料・送料・梱包材費・通信費・リサーチツール利用料など、せどりの事業に直接関係する支出です。プライベートと兼用のものは家事按分を行い、適正な割合で計上しましょう。

確定申告の手順は、帳簿付け→棚卸し→申告書作成→提出の流れで進めます。クラウド会計ソフトを活用すれば記帳から申告書の提出まで効率的に完了でき、初心者でも安心して取り組めます。副業の方は住民税の普通徴収への切り替えも忘れずに手続きしましょう。正しく申告して不要なリスクを避けつつ、節税できるポイントはしっかり押さえていきましょう。

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せどりの確定申告のやり方｜副業でも必要？経費や青色申告の手順をわかりやすく解説